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化合物库里缺“药”,导致新抗生素发现困境

俄克拉荷马州大学、斯隆-凯特林纪念癌症中心和默克公司的一个合作研究小组在《Nature Chemical Biology》杂志上发表了一篇评论文章,讨论了新抗生素挖掘有哪些值得探索的地方。

文章作者Zgurskaya说:“临床上抗药性细菌的迅速传播对我们的现代医学提出了挑战,传统的抗生素发现方法无法产生治疗耐药感染所需的新药。目前的COVID-19大流行进一步扩大了这个问题,因为重症监护病房的病人特别容易受到细菌感染。(我们)团队正致力于开发新工具,以指导新抗菌剂的发现和优化。”

抗生素耐药性的不断增加给医疗保健带来了重大挑战,如果没有创新的解决方案,这种情况将逐渐恶化。

Zgurskaya说:“特别是革兰氏阴性病原体在生物和化学方面都存在挑战,阻碍了新抗菌药物的发现。”

在文章中,作者提出,首先细菌通过低渗透屏障(两个不同渗透性的膜)来保护自身免受各种结构的药物侵害,这使得大多数化合物不可透过细胞包膜;第二,目前用于药物研发的化学文库中很少有能穿透革兰氏阴性菌的化合物,也就是说化合物储备不足,导致密集的筛选活动几乎没有取得成功。“这突出表明需要新的方法来确定与抗菌药物发现特别相关的化学空间区域,”Zgurskaya说。

在这篇文章中,研究小组概述了对这个问题的新见解,并概述了研究人员和科学家解决这个问题的一般方法。

开发预测革兰氏阴性细菌化合物积累的化学信息学工具的综合方法

研究小组侧重研究革兰氏阴性菌中具有积累能力的化合物,第一个目标是“开发可靠的化学信息工具来预测革兰氏阴性菌的渗透和流出,然后用来指导药物化学活动和抗菌发现库的设计。”

原文检索:Defining new chemical space for drug penetration into Gram-negative bacteria


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