Cell：有史以来第一个真菌生物组图谱，描述了癌症和真菌之间的联系！

由加州大学圣地亚哥医学院的研究人员共同领导的一个国际科学家团队创建了第一个泛癌症真菌生物组图——对35种癌症及其相关真菌的调查。

癌细胞和微生物有着长期而持久的联系。它们在人体的生态系统中共同进化，通常依赖相同的资源。对这些资源的竞争往往会影响癌细胞、微生物和人类宿主的复制和生存。

癌症和个别微生物之间的联系长期以来一直是逐个研究的，但最近的关注更多地集中在整个人类微生物群上，特别是在肠道中，它比人体内部或外部的任何地方都容纳更多、更多样化的细菌、病毒和真菌群落。

然而，与癌症相关的真菌的作用和影响在很大程度上仍未被研究和未知。真菌是比病毒和细菌更复杂的生物。它们是真核生物——细胞中含有细胞核的生物。与细菌或病毒相比，它们的细胞更类似于动物细胞。

“真菌在大多数人类癌症中的存在是令人惊讶的，也是意料之中的，”Rob Knight博士说，他是加州大学圣地亚哥医学院的儿科教授，也是Micronoma的联合创始人，这是一家位于圣地亚哥的公司，开发血液和组织中的微生物生物标志物，用于诊断和治疗癌症。

“这令人惊讶，因为我们不知道真菌是如何进入全身肿瘤的。但这也是值得期待的，因为它符合包括肠道、口腔和皮肤在内的全身健康微生物群的模式，细菌和真菌在这些地方相互作用，成为复杂群落的一部分。”

在人体上发现的真菌主要有两种:一种是环境真菌，如酵母和霉菌，它们通常对大多数健康的人没有伤害;另一种是共生真菌，它们生活在人体上或体内，可能是无害的，对人体有好处，如改善肠道健康，或导致疾病，如酵母感染或肝脏疾病。真菌也在塑造宿主免疫力方面发挥作用，这在免疫功能低下的人(包括癌症患者)中显得尤为突出。

这项新研究描述了癌症菌群——与癌症相关的真菌——在17,401份患者组织、血液和血浆样本中，涵盖了四组独立的35种癌症。研究人员发现，在许多主要的人类癌症中，真菌DNA和细胞的丰度很低，不同癌症类型的真菌群落组成不同。

将真菌群落与匹配的菌组(微生物组的细菌组成部分)和免疫组(组成免疫系统的基因和蛋白质)进行比较的分析显示，它们之间的联系通常是“允许的”，而不是竞争的。

例如，一种真菌在50岁以上患者的乳腺癌肿瘤中富集，而另一种真菌在肺癌样本中明显富集。

研究人员说，特定真菌与年龄、肿瘤亚型、吸烟状况、对免疫治疗的反应和生存措施之间存在显著相关性。这些真菌是单纯相关还是因果相关还有待确定。

“这些发现证实了微生物组整体上是癌症生物学的一个关键部分的观点，”该研究的合著者Gregory Sepich-Poore博士说，他是Micronoma的联合创始人和首席分析官，“并可能带来重大的转化机会，不仅在癌症检测，而且在其他与药物开发、癌症进化、最小残留疾病、复发和伴发诊断相关的生物技术应用中。”

原文标题：

Pan-cancer analyses reveal cancer-type-specific fungal ecologies and bacteriome interactions