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X染色体在一些男性癌症中是沉默的

Graphical abstract depicting the study’s workflow

    


癌细胞获得了基因异常,使它们能够不受抑制地生长和增殖。研究人员现在发现了癌细胞和正常细胞的另一个区别:X染色体,通常只在XX女性细胞中失活,在不同的男性来源的癌症中可以失活。这项研究于11月9日发表在Cell Systems。

“为了平衡性别之间的基因表达,在正常发育过程中,女性X染色体的一个拷贝在人体中随机失活。我们想知道,在基因不稳定的男性或女性癌细胞中,这个正常发育过程是否会出错,”达纳-法伯癌症研究所的癌症遗传学家和医学肿瘤学家、资深作者Srinivas Viswanathan。

通过使用公开的数据集,包括来自世界各地癌症患者的数千个DNA样本,研究团队偶然发现了高表达的XIST该基因负责关闭X染色体上的基因表达——在被分析的男性癌症样本中,该基因约占4%。

XIST可能在所有性别的早期发育中都有表达,X失活被认为是女性在发育后期特有的过程。此前研究表明,一些女性癌细胞可能失去关闭一条X染色体的能力,导致X连锁基因表达增加,但这种X失活的能力仍然主要只在女性细胞中进行研究。

在4%的异常男性癌症样本中,74%来自已被证明能使X染色体失活的生殖器官癌症,但其余26%来自其他癌症类型的样本。这些癌症包括肝癌、脑癌、皮肤癌、心脏病、肺癌和甲状腺癌。

“我们对这个结果感到非常惊讶XIST 是一种通常用于对女性癌症进行分类的转录本,所以我们想确保这不仅仅是注释错误的结果。然而,我们确实看到一些不同亚型的男性癌症激活XIST,并显示X失活的特征,”Viswanathan说。

“我们必须意识到使用这类数据集的注意事项。这些样本已经在很多人手中,因此人为错误的空间更大,”达纳-法伯癌症研究所的癌症生物学家Cheng-Zhong Zhang说。“这是我们最大的不确定性来源;我们必须创造性地看待数据并找到控制方法。”

对这种现象发生的一个可能的解释是基因不稳定。癌症通常有多个染色体副本,如果一个细胞中碰巧有两条X染色体,那么就有必要通过激活其中一条来使其失活XIST无论这个细胞是在女性体内还是在男性体内。

“另一种可能性是,X染色体上有一些重要的基因,当它们被抑制时,癌症就会生长。我们将在未来的研究中对此进行调查,”Viswanathan说。

Viswanathan说:“在某种程度上,性别是最终的生物标记,因为它将人类群体进行了细分,但我们通常不考虑性别之间的基因差异如何影响癌症的预后或治疗反应。”


原文:Somatic XIST activation and features of X chromosome inactivation in male human cancers


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