《Nature Microbiology》新方法：五分钟内揭示细菌对抗生素的反应

卡罗林斯卡医学院微生物学、肿瘤和细胞生物学系副教授、首席研究员Vicent Pelechano说:“我们有信心并希望这能成为医生应对抗生素耐药性所需的众多工具之一，抗生素耐药性是一个严重且日益严重的问题。”

这种方法被称为5PSeq，使用简单，基于对细菌在合成蛋白质时分解的信使RNA (mRNA)进行测序。这些测量揭示了细菌是如何受到不同环境因素的影响的，比如抗生素治疗和其他类型的压力。

用于临床的快速检测

研究人员对来自不同门的96种细菌进行了测试，这些细菌来自复杂的临床样本，例如粪便和阴道，以及堆肥样本。仅仅几分钟后，他们就能看到细菌是否对抗生素治疗有反应;大约半小时后效果最为明显。

3N Bio是Pelechano博士和他的一些同事在KI创新孵化器中创立的一家公司，旨在开发这种方法，并创建一种用于临床的快速分子检测方法。他们现在得到了瑞典研究委员会的资助，与卡罗林斯卡大学医院合作，证明了这种测试的概念。

“至关重要的是，医生能够迅速为患有细菌感染的重症患者找到合适的抗生素，以减少不必要的抗生素使用，”Pelechano博士说。“目前检测抗生素耐药性的方法可能需要数小时甚至数天，但通常需要更及时地给予治疗，以避免对患者造成严重后果。正因为如此，通常会开广谱抗生素，这增加了耐药性的风险。”

研究细菌如何相互作用

除了测量抗生素耐药性之外，这种方法还可以帮助研究人员了解细菌如何应对压力，如何相互作用，以及如何与宿主相互作用。研究人员将继续研究复杂的肠道样本，以研究细菌群落如何在我们的肠道中相互作用，并对健康和疾病做出贡献。

原文：Atlas of mRNA translation and decay for bacteria