PNAS：在RNA上发现了一个可以缩短炎症的靶标

加州大学圣克鲁兹分校的研究人员在人类RNA中发现了一种调节炎症的肽，这可能为治疗关节炎和狼疮等疾病提供新的途径。该团队使用基于强大的基因编辑工具CRISPR的筛选过程，揭示了关于我们rna的最大谜团之一-负责执行我们DNA中包含的遗传信息的分子。

这种肽起源于一种叫做LOUP的长链非编码RNA (lncRNA)。据研究人员称，人类基因组编码超过20,000个lncrna，使其成为基因组产生的最大基因群。但尽管如此，科学家们对lncrna存在的原因以及它们的作用知之甚少。这就是为什么lncRNA有时被称为“基因组的暗物质”。

这项研究发表在2024年5月23日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上，是现有文献中为数不多的揭示lncRNA奥秘的研究之一。这也为快速鉴定免疫细胞中功能性lncrna提供了一种高通量筛选的新策略。混合筛选方法允许研究人员在一次实验中针对数千个基因，这是一种比传统实验更有效的研究基因组未表征部分的方法，而传统实验一次只关注一个基因。

这项研究是由免疫学家Susan Carpenter领导的，她是加州大学圣克鲁兹分校分子、细胞和发育生物系的教授和Sinsheimer主席。她研究预防感染的分子机制。具体来说，她专注于导致炎症的过程，以确定lncrna在这些途径中发挥的作用。

“炎症是几乎所有疾病的核心特征，在这项研究中，我的实验室专注于试图确定哪些lncRNA基因参与调节炎症。”

这意味着研究一种被称为单核细胞的白细胞中的lncrna。他们使用CRISPR/Cas9技术的一种修改，称为CRISPR抑制(CRISPRi)，来抑制基因转录，并找出单核细胞的lncrna中哪一种在它是否分化为巨噬细胞中起作用，巨噬细胞是另一种白细胞，对功能良好的免疫反应至关重要。

此外，研究人员使用CRISPRi筛选巨噬细胞lncRNA参与炎症。出乎意料的是，他们发现了一个多功能区域，既可以作为RNA工作，也可以包含一种未被发现的调节炎症的肽。

Susan Carpenter说，了解了这种特殊的肽调节炎症，制药商就有了一个目标，可以阻断反应背后的分子相互作用，从而抑制炎症。“在理想情况下，你可以设计一个小分子来破坏这种特定的相互作用，而不是瞄准一种可能在全身表达的蛋白质，”她解释说。“我们距离精确定位这些通路还有很长的路要走，但这绝对是我们的目标。现在人们对RNA疗法很感兴趣。”