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Nature子刊研究建议谨慎对待CRISPR疗法

美国国家癌症研究所(NCI)、桑福德•伯纳姆•普雷比医学研究所等机构开展的一项综合研究表明,利用CRISPR-Cas9开展的基因编辑(特别是基因敲除)可能有利于带有癌症相关突变的细胞。

这项研究成果发表在《Nature Communications》杂志上,强调有必要对接受CRISPR-Cas9基因治疗的患者进行癌症相关突变的监测。

桑福德•伯纳姆•普雷比医学研究所的Ani Deshpande博士指出:“我们的研究表明,在许多不同的细胞类型中,CRISPR基因编辑可以为某些细胞赋予选择性优势,比如p53或KRAS带有突变的细胞。我们发现,在使用CRISPR-Cas9编辑基因组时,带有癌症相关突变的细胞更有可能存活下来——这比科学家之前了解的更为普遍。”

CRISPR-Cas9的工作原理是在DNA序列的特定位点上产生双链DNA断裂,使科学家能够靶向和编辑特定的基因。然而,p53基因对双链断裂的反应是阻止细胞生长,这意味着编辑过的细胞的生长和分裂效率会降低。那么,p53基因带有突变的细胞可以继续正常生长和分裂,从而具有竞争优势。

如果细胞的基因组出现错误,p53基因会阻止细胞分裂,并试图纠正这个问题。如果错误无法修复,那么p53将在细胞癌变之前启动细胞程序性死亡。这使得p53成为一个重要的抗癌基因,失去其功能会使人们更容易形成肿瘤。

“p53基因如此重要,以至于它往往被戏称为‘基因组的守护者’,”Deshpande说。

由Eytan Ruppin博士领导的计算生物学家分析了近1000个人类细胞系中p53对双链断裂的反应。Eytan Ruppin博士是NCI癌症研究中心癌症数据科学实验室主任,也是这项研究的共同负责人。

在几乎所有的细胞类型中,他们发现CRISPR-Cas9 KO后,带有p53正常基因的细胞生长较慢,而带有p53突变基因的细胞受影响较小,因此它们生长更快,并超过正常细胞。他们还发现,CRISPR可能会给带有其他癌症相关突变的细胞带来优势,比如KRAS癌基因。

“这不是研究人员第一次证明CRISPR可能会带来潜在的危险变化,”Ruppin谈道,“然而,这是第一次在这么多不同的细胞中证明这些影响。”

这些发现表明,在使用基于CRISPR的基因疗法时需要谨慎,特别是在治疗p53或KRAS基因带有突变的个体时。“目前人们正在开发CRISPR疗法来纠正许多人体组织中的突变,但正如其他人之前指出的那样,我们需要谨慎行事,因为在使用CRISPR- cas9编辑时,我们可能会选择出关键癌症驱动基因携带突变的细胞,而这可能有潜在危险。不过,幸运的是,最近开发的新型CRISPR编辑技术不太可能存在这种风险,”Ruppin补充道。

“早期的CRISPR技术会产生双链断裂,但更现代的版本可以更简单地对目标DNA进行编辑,”Deshpande说。“如果我们使用非切割版本的CRISPR,我们可能会避免许多问题,这对患者来说也许是个好消息。”

尽管存在潜在风险,但作者认为CRISPR仍是一种令人兴奋的变革性方法,而且像这样的障碍并非不可逾越。两位资深作者都指出,有前途的医疗技术通常必须克服障碍,才能足够安全地用于患者。

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Sinha, S., Barbosa, K., Cheng, K. et al. A systematic genome-wide mapping of oncogenic mutation selection during CRISPR-Cas9 genome editing. Nat Commun 12, 6512 (2021). https://doi.org/10.1038/s41467-021-26788-6


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