《Nature Protocols》蛋白质足印法配方

Michael Gross是圣路易斯华盛顿大学文理化学教授，医学院免疫学和内科学教授，他的团队是蛋白质足印法的专家，使用先进的方法来研究大分子中蛋白质的结构和相互作用。

通过分享一个名为快速光化学氧化蛋白质（FPOP）的方法，他们希望支持其他实验室开发更广泛的FPOP应用，以更好地解决结构生物学中的突出问题。

尽管FPOP具有令人信服的优势，但建立平台的技术困难导致了广泛应用的滞后。Liu列举了一些挑战，包括选择合适的激光器、设置激光光学器件、建立流动系统、获取足印以及通过质谱分析结果。

Gross说：“我们一直认为，传播FPOP的最佳方式是应用程序。在它的发现之后，我们已经将其应用于生物化学和生物物理的问题上。”

快速蛋白质折叠有助于抗原表位的定位，表位是免疫系统识别的抗原的组成部分。这一应用对于科学家和医学专业人士来说可能是重要的。

其他的应用可能包括理解聚集蛋白，这与阿尔茨海默病有关；揭示其他结构方法看不见的隐藏构象变化；确定与蛋白质结合的小分子的结合位点和结合亲和力。

Gross还说：“目前，在与生物化学和分子生物物理学系的Weikai Li的合作下，我们正在进入跨膜和膜相关蛋白领域，这类重要蛋白质急需新的结构方法。”

原文检索：Protein higher-order-structure determination by fast photochemical oxidation of proteins and mass spectrometry analysis