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发现新抗生素靶点,有望治疗多重耐药超级细菌

由挪威UiT北极大学开发的AMC-109在实验室和临床试验中都显示出有希望的结果,可以对抗众所周知的难以治疗的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)。它将很快在人体上进行测试(临床试验的第三阶段)。然而,尚不清楚AMC-109是如何作用于细菌的。“我觉得很奇怪,没有人知道它到底是如何工作的,”Melcrová说。“所以,我决定去看看。”

许多抗生素是通过在细菌的膜上打孔来起作用的,这在细菌的内部和外部之间形成了一个边界。这层膜对调节什么进入什么离开至关重要,也对在细菌周围建立保护性细胞壁至关重要。Melcrová说:“参与这项研究的药物开发人员认为,AMC-109就像其他抗生素一样,会在细菌的膜上打洞。”但这并不是她的发现。

Melcrová取的是由格罗宁根大学分子微生物组为她提取的金黄色葡萄球菌膜。Melcrová在Wouter Roos教授的生物物理小组工作,正如她解释的那样,“我们用物理学的方法研究生物学。”和她的同事Sourav Maity一起,用高速原子力显微镜(HS-AFM)研究细菌膜,用一个微小的尖端快速敲击材料,测量材料的厚度和刚度。

Melcrová和Maity用HS-AFM看到的是膜厚度较高的小区域,表明某种结构组织。在膜中加入AMC-109后,这些较厚的区域聚集在一起,然后溶解。这些区域的破坏足以导致细菌死亡。

Josef Melcr与分子动力学小组合作,利用Martini力场建立了膜与抗生素相互作用的模拟模型。模拟结果显示,AMC-109会形成小团块。随后,这些团块渗入细菌膜。

有几种疾病是由蛋白质聚集引起的,比如阿尔茨海默病。但在这种情况下,这是一件非常好的事情。AMC-109本身也会攻击人体细胞。但是通过聚在一起,一些特性被“隐藏”在聚在一起的AMC-109内部,使其对人体安全。

增加其他抗生素

既然AMC-109对细菌膜的作用更清楚了,未来药物开发的新可能性就打开了。例如,可以开发出明确旨在破坏膜结构的药物。也有证据表明,这种混乱破坏了细菌对传统抗生素的抵抗力。这仍然是一个假设,但这可能意味着用AMC-109治疗也可能增强‘经典’抗生素的效果。

漫长的四年

“我很高兴这项工作终于出来了,”Melcrová说。“这花了四年漫长的工作。我们经历了很多压力、挫折和争论,但我们也很享受这些伟大的发现,并把这种独特的抗生素作用的谜团放在一起。事实上,合作者之一Josef Melcr也是我的丈夫,这意味着这个项目一直伴随着我,即使在家里。”

原文:Lateral membrane organization as target of an antimicrobial peptidomimetic compound,Nature Communications


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