先天免疫提供了针对病原体和体内稳态扰动的关键第一道防线。模式识别受体(pattern recognition receptors,PRRs)检测这些干扰,并通过多蛋白复合物形成启动免疫应答,驱动炎症信号传导和细胞死亡通路。这些传感器形成的关键胞质复合物包括炎症小体和PANoptosomes。炎症小体诱导caspase-1激活以及随后白细胞介素(interleukin,IL)-1β和IL-18的成熟,并且它们可以作为更大PANoptosomes的组成部分,后者的形成和功能已通过遗传学、生物化学和单细胞成像证据得以明确。PANoptosomes诱导溶解性、炎症性细胞死亡(PANoptosis),并促进损伤相关分子模式(damage-associated molecular patterns,DAMPs)及IL-1β和IL-18之外的细胞因子(包括TNF、IFNs、IL-6等)的释放。鉴于它们在驱动细胞死亡以及释放细胞因子和DAMPs中的关键功能,先天免疫传感器的失调与多种疾病相关,包括感染、自身炎症综合征、心血管疾病、神经退行性疾病、代谢性疾病和癌症。因此,理解先天免疫传感器及其如何组装炎症小体和PANoptosomes以驱动细胞死亡,对于确定治疗策略至关重要。在本综述中,研究人员讨论了形成炎症小体和PANoptosomes的先天免疫传感器,如NLRP1、NLRP3、NLRC4、AIM2、Pyrin等。研究人员重点介绍了这些传感器的最新结构和机制见解,以及炎症小体组装的新兴结构研究和支持PANoptosomes形成的生物化学及功能证据。鉴于先天免疫传感器及其在疾病谱中形成的复合物的生理相关性,对其结构-功能关系的更深入理解将对指导靶向这些分子、其相关复合物及其生理功能的治疗策略至关重要。
引言:先天免疫系统通过模式识别受体(PRRs)识别病原体或损伤相关分子模式,启动炎症信号和细胞死亡。关键胞质传感器包括NLRP1、NLRP3、NLRC4、AIM2、Pyrin等,它们组装炎症小体或多蛋白PANoptosome复合物。炎症小体激活caspase-1,成熟IL-1β/IL-18;PANoptosomes驱动PANoptosis,释放DAMPs和更多细胞因子。目前尚无完整高分辨率结构,但遗传、生化、成像证据已确立复合物形成。本文综述结构-机制见解和治疗意义。
NLRP1的结构特征:NLRP1是人类首个发现的炎症小体传感器。人NLRP1包含PYD、NACHT、LRR、FIIND和CARD结构域,FIIND发生自水解产生UPA-CARD片段。DPP8/9通过结合UPA-CARD抑制其寡聚,VbP竞争性解除抑制。冷冻电镜(cryo-EM)结构显示DPP9与NLRP1复合物的作用方式,UPA寡聚促进CARD丝形成,丝结构呈玉米棒状。氧化型硫氧还蛋白1(oxTRX1)和泛素化调节其稳定性与降解。
靶向NLRP1及其在疾病中的作用:NLRP1参与神经炎症、自身免疫病和炎症性疾病。创伤性脑损伤患者脑脊液外泌体含NLRP1成分。M1184V、L155H等突变与多种疾病相关。靶向NLRP1与DPP8/9的相互作用或聚合物形成是潜在治疗策略。
NLRP3的结构特征:NLRP3由PYD、NACHT、LRR组成,激活机制复杂。cryo-EM显示ADP结合的非活性“耳环”构象,NEK7参与开放笼状结构。激活后形成盘状寡聚体,PYD丝招募ASC。亚细胞定位和翻译后修饰(PTM)如S-棕榈酰化、泛素化、磷酸化调控其活性,液相-液相分离(LLPS)也参与组装。NLRP3还是多种PANoptosome的组成部分。
非经典炎症小体调控通路:非经典通路中,胞质脂多糖(LPS)直接激活caspase-11(小鼠)或caspase-4/5(人),切割gasdermin D(GSDMD)形成膜孔,引起稳态扰动,间接激活NLRP3。结构研究显示炎症caspase的CARD结构域和底物识别机制。
靶向NLRP3及其在疾病中的作用:NLRP3与冷吡啉相关周期综合征(CAPS)、痛风、阿尔茨海默病、2型糖尿病等广泛疾病相关。在癌症中作用复杂。MCC950等抑制剂通过稳定非活性构象发挥作用,但存在毒性。NEK7降解剂等上游策略也在发展。结构生物学为药物设计提供基础。
NAIP–NLRC4的结构特征:NAIP是细菌配体受体,人有一个,小鼠有六个。NAIP含BIR结构域,识别鞭毛蛋白或针状蛋白。配体结合导致NAIP构象变化,暴露成核界面,招募NLRC4。NLRC4由CARD、NACHT、LRR组成。cryo-EM显示NAIP-NLRC4盘状复合物,含10-12个亚基。NLRC4从自抑制关闭构象转变为开放状态,通过CARD-CARD招募caspase-1。
靶向NLRC4及其在疾病中的作用:NLRC4在细菌感染防御中重要,病原体通过III型分泌系统等策略逃逸。NLRC4参与癌症,既有促肿瘤也有抑肿瘤作用。功能获得性突变如T337A、H443P导致自身炎症。结构信息有助于设计稳定自抑制构象或阻断寡聚的抑制剂。
AIM2的结构特征:AIM2识别胞质双链DNA(dsDNA),属于PYHIN家族,含N端PYD和C端HIN结构域。HIN结构域包含两个OB折叠,以正电荷表面结合DNA骨架。约80 bp DNA可被约20个AIM2分子包裹。AIM2 PYD形成六螺旋束,并组装成螺旋丝。三种典型相互作用介导丝组装。HIN结合DNA释放自抑制,PYD丝作为ASC招募平台。
靶向AIM2及其在疾病中的作用:AIM2参与抗细菌和DNA病毒免疫,病毒如单纯疱疹病毒1型(HSV-1)VP22、人巨细胞病毒(HCMV)pUL83抑制AIM2。AIM2表达异常与自身免疫病和癌症相关。结构指导的药物设计可阻断DNA结合或AIM2-ASC界面。AIM2-PANoptosome在土拉弗朗西斯菌感染中发挥作用。
Pyrin的结构特征:Pyrin检测RhoA GTPase抑制。包含PYD、含磷酸化位点的接头、B-box锌指、卷曲螺旋(CC)和B30.2结构域。B30.2结构域为β-折叠桶,富含家族性地中海热(FMF)突变。CC结构域形成“衣架”状二聚化支架。磷酸化S208/S242招募14-3-3维持自抑制,去磷酸化解除抑制,PYD招募ASC。
靶向Pyrin及其在疾病中的作用:Pyrin突变导致FMF,M694V最严重。也与其他周期性发热综合征相关。秋水仙碱用于治疗,但缺乏特异性。需开发靶向Pyrin的特异性抑制剂。
其他可能形成炎症小体和PANoptosome的分子:NLRC5作为MHC-I转录调控子,也形成PANoptosome,与NLRP3、ASC相互作用,驱动NAD+耗竭诱导的PANoptosis。NLRP12负调控炎症,也组装PANoptosome,与NLRP3、NLRC5相互作用,在特定感染和肿瘤中起双重作用。NLRP6识别细菌成分和dsRNA,通过LLPS激活,参与肠道稳态。NLRP9在肠上皮表达,NLRP9b识别轮状病毒dsRNA,但结构信息有限。IFI16含双HIN结构域,识别dsDNA,参与核内DNA传感和炎症小体形成,与AIM2协同。
总结和未来展望:结构研究已揭示传感器激活的共享机制:从自抑制到活性状态的构象转变,通过同型相互作用形成丝状组装。治疗上可靶向传感器本身或下游效应分子。组合疗法和生物标志物有助于优化。仍需解决完整复合物的高分辨率结构、生理相关触发因素、动态组装机制等开放问题。开放问题包括识别更多生理相关触发因素和上游调控过程,解析炎症小体和PANoptosome的原子分辨率结构,定义传感器与核心组分如caspase-8、ASC、RIPKs的接口。整合cryo-ET、定量蛋白质组学和基因编辑等方法将推动结构-功能研究和治疗策略的开发。