泰国奶牛牛血原体的分子发生情况与遗传多样性分析

背景

奶牛是泰国重要的牲畜，可能受到感染源的影响，其中包括嗜血支原体属（血原体），这可能导致经济损失和生产力下降。两种常见的牛血原体物种，维容氏支原体（Mw）和“候选”牛嗜血支原体（CMhb），已在世界各地被报道。然而，尽管假设几种推测物种在牛或水牛中循环传播，但来自泰国的 Mw 和 CMhb 的全面遗传分析仍然有限。

方法

在本研究中，我们利用 16S 和 23S rRNA 基因，调查了泰国 522 头奶牛中牛血原体的分子发生情况和遗传多样性。总共筛查了 522 份血样以检测血原体感染，使用的是针对 16S rRNA 基因的 PCR。在 161 份 PCR 阳性样本中，非随机选择了 52 份子集，主要基于强且清晰的 PCR 条带进行选择，并成功对 16S 和 23S rRNA 基因进行了测序。

结果

PCR 在 30.8%（161/522；95% CI 26.9%–35.0%）的牛中检测到血原体。在 161 份阳性样本中，52 份成功完成了 16S 和 23S rRNA 基因的测序。在 52 份非随机选择的样本中，系统发育分析鉴定了归属于两个已公认的牛血原体分类单元的序列，以及 Mw 复合群内的另外两个分歧谱系。这些谱系暂时被视为候选谱系，有待进行基因组和生物学表征。

结论

本研究展示了泰国奶牛 Mw 复合群内被低估的遗传多样性。这些分歧谱系是基于部分 16S 和 23S rRNA 基因序列的分析鉴定的。确认其分类状态将需要全基因组测序、额外的独立遗传标记以及生物学表征，包括对其致病性和传播的调查。

图形摘要