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SCIENCE:转录因子通过稳定RNAP结合实现基因表达稳态调控的普适机制

转录因子(TFs)通过一种普遍的内稳态机制调控启动子活性,打破了传统"激活因子/抑制因子"的二元分类范式。研究表明,TFs的功能取决于其调控的启动子特性——激活因子对强启动子的激活作用减弱,而抑制因子对强启动子的抑制作用增强。这种逆缩放关系遵循热力学模型预测:当TFs与RNA聚合酶(RNAP)存在稳定化(正相互作用)时,fold change随启动子基础强度增加而降低。

通过系统测量多种TFs(包括激活因子和抑制因子)在不同培养基、RNAP浓度和突变启动子库中的调控效果,发现所有TFs均呈现相同规律:调控倍数与启动子基础强度呈精确反比关系。这意味着TFs通过稳定RNAP与启动子的结合,使不同基础活性的启动子最终达到相同的调控表达水平,从而缓冲遗传或环境扰动对基因表达的影响。

该发现揭示了TFs的核心功能是维持基因表达稳态:强启动子被适度抑制,弱启动子被有效激活,最终使所有受调控基因表达趋于一致。这种缓冲机制为生物体应对内外环境变化提供了安全保障,深化了对基因调控网络鲁棒性的理解。研究通过定量实验验证了热力学模型的预测,证明多种TFs(如CRP、LacI等)均通过稳定RNAP结合的机制实现调控,为合成生物学和疾病治疗中的基因回路设计提供了理论基础。


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