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抑制有害DNA变化的“拯救突变”可以揭示遗传疾病

洛桑大学威尔科姆桑格研究所的科学家及其合作者发现了有关DNA克服有害基因变化能力的新见解。研究小组发现,26%的有害突变被至少一种野生酵母菌株的自然变异所抑制。在每一个详细检查的实例中,一个单一的“拯救突变”负责消除另一个可能威胁生物体生存的突变。

这项研究发表在今天(2021年5月27日)的《分子系统生物学》(Molecular Systems Biology)上,提供有关DNA变体如何抑制不希望的基因变化的重要信息。如果在人类身上得到证实,这种生物现象可能在遗传疾病(如癌症或罕见的发育障碍)中发挥重要作用,并解释为什么某些患者比其他患者患上更严重的疾病。

突变是形成多细胞生物遗传密码的DNA字母的变化。它们可能是由于细胞分裂过程中DNA复制的错误,或紫外线等环境照射的影响。虽然大多数突变对细胞的功能没有显著影响,但有些突变可能有害,并导致癌症等遗传疾病。其他突变可能是有益的,并通过自然进化过程促进物种的遗传多样性1

由于人类基因组中有60亿个字母的DNA,自然遗传变异的影响是巨大的。因此,突变对基因和细胞功能的确切影响尚不完全清楚。对一个人有害的突变对另一个人可能没有负面影响。在某些情况下,这是因为健康或有弹性的个体携带额外的突变,称为抑制因子,可以抵消有害的DNA变化。

在这项研究中,多伦多大学的研究人员筛选了1,从10个野生酵母菌株的580个基本基因3中提取106个温度敏感等位基因2,研究自然遗传变异是否能使酵母在不利的高温下生长。

他们发现,至少一个野生酵母菌株的自然变异可以绕过580个基本基因中的26%。为了寻找能够抑制这种温度敏感等位基因的特定突变,威尔科姆桑格研究所对继续生长的酵母菌落进行了测序。

洛桑大学的Jolanda van Leeuwen教授,他说:“关键基因中有害突变被抑制的比例出乎意料,而且由于我们只对一小部分野生酵母菌株进行了采样,因此可以被自然变异抑制的突变比例可能要高得多。抑制的频率表明,它在其他情况下也可能做出重要贡献,包括潜在的人类疾病。”

洛桑大学的研究人员详细研究了10个抑制实例,以更好地了解抑制效果及其如何保护细胞。令他们惊讶的是,在每一个病例中,只有一个突变能抑制对温度敏感的等位基因,使细胞能够存活和繁殖。

Wellcome-Sanger研究所论文的资深作者Leopold Parts博士说:“在生物学中,解释往往很复杂,因此发现一个‘吸烟枪’是不寻常的。我们可能期望有许多基因结合起来,以克服像温度敏感等位基因这样的严重遗传缺陷,因此,这是一个单一突变的结果是非常令人惊讶的。”

桑格研究所已经在进行一项类似的研究,利用从健康捐赠者那里获得的商用人类细胞系,研究这些发现与人类基因组的相关性。如果同样的生物现象在起作用,它可以提供有价值的信息,说明遗传疾病是如何产生的,以及“抢救性突变”是否有一天可以帮助临床医生治疗这些疾病。

注意:

1.有关基因突变的概述,请参阅yourgenome.org

2.等位基因是同一基因的变体形式。等位基因的组合影响个体的身体特征,比如眼睛的颜色。有关更多信息,请访问yourgenome.org

3.关键基因是细胞生存和繁殖所必需的

Journal Reference:

  1. Leopold Parts, Amandine Batté, Maykel Lopes, Michael W Yuen, Meredith Laver, Bryan‐Joseph San Luis, Jia‐Xing Yue, Carles Pons, Elise Eray, Patrick Aloy, Gianni Liti, Jolanda Leeuwen. Natural variants suppress mutations in hundreds of essential genes. Molecular Systems Biology, 2021; 17 (5) DOI: 10.15252/msb.202010138


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